Социальная значимость стоящих перед службой задач, специфичность экстренной медицины предъявляют особые требования к квалификации и профессиональной ответственности сотрудников СЭМ. РНЦЭМП является основной учебной базой повышения квалификации врачей системы экстренной медицинской помощи. Ежегодно в одном только Центре проходят повышение квалификации свыше 1000 врачей.

Работу научно-организационного отдела РНЦЭМП непосредственно координируют заместитель генерального директора по науке и подготовке кадров Камал Саидакбарович Ризаев и ученый секретарь Тиляков Акбар Буриевич. Руководителем отдела является д.м.н. Арзикулов Туракул Садыкович. Отдел состоит из сектора печати, осуществляющего под руководством доктора медицинских наук Бахтиёра Закировича Касимова организацию сбора, технической экспертизы и мониторинга научных публикаций, а также сектора подготовки и переподготовки кадров под руководством доктора медицинских наук, профессора Джамшида Азизовича Исмаилова.

Отдел осуществляет организацию, координацию и контроль научно-исследовательской деятельности структурных подразделений Центра, проводит анализ состояния, прогнозирование и определение приоритетных направлений развития науки, формирует приоритетные направления научных исследований, осуществляет научно-методическое обеспечение высокого технического уровня результатов выполняемых в центре  научно-исследовательских работ, направленных на разработку и подготовки высокоспециализированных специалистов для РНЦЭМП, его областных филиалов и районных субфилиалов, а также оформление и регистрация договоров о научно-техническом сотрудничестве, актов внедрения в научный  и лечебный процесс, ведет патентно-информационное обеспечение научных исследований.

РНЦЭМП стал инициатором создания государственного «Фонда поддержки и развития СЭМП» (2003 г.), включения в учебную программу медицинских вузов углубленного изучения вопросов ЭМП, открыта магистратура по специальности «Экстренная медицинская помощь». Налажена подготовка, переподготовка и повышение квалификации на базе ведущих зарубежных клиник — России, Украины, Молдовы, Турции, Австрии, Японии, Кореи, Литвы, Франции, Великобритании, США. Всего за рубежом повысили свою квалификацию более 400 врачей.

С 2001 года в РНЦЭМП ведется подготовка специалистов через клиническую ординатуру и докторантурупо наиболее востребованным в региональных подразделениях службы специальностям (хирургия, сосудистая хирургия и микрохирургия, торакальная хирургия, травматология, нейрохирургия, терапия, кардиология, неврология, педиатрия, патологическая анатомия и др.), подготовлены и направлены на работу на места сотни клинических ординаторов. По наиболее актуальным проблемам экстренной медицины успешно защищены 56кандидатских и 16 докторских диссертаций.

Введенный в эксплуатацию Учебно-информационный Центр РНЦЭМП, с библиотекой, архивом, лекционными и практическими залами, с тренажерами и симуляторами, предоставляет прекрасную возможность сотрудникам Центра и филиалов получить современные знания и повысить профессиональные навыки в лапароскопии и медицинской визуализации.

Для стимуляции здорового образа жизни сотрудников построены новый тренажерный зал и крытый бассейн.